Depuis le début de l’épidémie de coronavirus on parle beaucoup du R effectif, un indicateur présenté comme le reflet de la vitesse de propagation du Sars-Cov-2, le virus responsable de la maladie Covid-19. Mais de quoi s’agit-il exactement ?

En langage médical, on dit que le R0 ou R effectif correspond au taux de reproduction de base d’un virus. En clair : “il s’agit du nombre de personnes qui peuvent potentiellement être contaminées par un individu infecté par un virus” explique le Dr. William Berrebi, gastro-entérologue et hépatologue, et ancien interne des Hôpitaux de Paris.

L’indicateur R0 n’est donc pas spécifique au coronavirus Sars-Cov-2 : on peut le mesurer pour n’importe quelle épidémie virale. “Au plus fort de l’épidémie de coronavirus, à la fin du mois de mars 2020, le R0 était de 3 ce qui signifie que chaque personne infectée pouvait transmettre le virus à environ 3 autres personnes, affirme le Dr. Berrebi. À titre de comparaison, le R0 de la rougeole est de 16 et celui de la gastro-entérite est de 17 : ce sont des virus qui circulent beaucoup plus facilement que le Sars-Cov-2 dans la population.

Le R effectif (R0) repasse au-dessus de 1 en France

Quelques repères. Lorsque le R0 d’une épidémie tombe à 0, le virus ne circule plus et l’épidémie s’éteint : a contrario, plus il est élevé, plus l’épidémie prend de l’ampleur. “Lorsque le R0 dépasse 1, on estime que l’épidémie est active : à l’époque, cela correspondait aux départements en orange sur la carte de France, note le Dr. Berrebi. Lorsqu’il atteint 1,5, c’est un seuil d’alerte.”

Le 11 juin 2020, le R0 du Sars-Cov-2 est tombé à 0,73 “surtout grâce aux mesures de confinement” rappelle le Dr. Berrebi.

“L’épidémie progresse moins fortement”, souligne Santé Publique France, dans son bulletin hebdomadaire publié ce vendredi 9 avril. “Le taux d’incidence a continué à progressé la dernière semaine de mars (+4%) mais de manière moins soutenue”, résume Santé Publique France.

Quant au R effectif, il est stable, toujours autour de 1, signe que l’épidémie continue à progresser. Pour le calculer, Santé Publique France s’appuie sur trois types de données : données virologiques (tests), hospitalisations et passages aux urgences.

Au 3 avril, en France métropolitaine, le nombre de reproduction calculé à partir des données virologiques reste au-dessus de 1, il est de 1,08 selon les derniers chiffres de Santé Publique France (1,02 la semaine dernière). Celui calculé à partir des données d’hospitalisations est de 0,97. Enfin, celui calculé avec les données de passages aux urgences est de 1,11. L’indicateur est toujours proche de 1, cela signifie qu’une personne infectée en contamine une autre et que par conséquent l’épidémie progresse en France.

Régions
R effectif (PCR) R effectif (urgences) R effectif (hospitalisations)
Auvergne-Rhône-Alpes 1,15 1,21 1,01
Bourgogne-Franche-Comté 1,19 1,13 1,06
Bretagne 1,12 0,99 1,00
Centre-Val de Loire 1,14 1,15 1,09
Corse 1,03 1,16 0,94
Grand Est 1,08 1,13 1,03
Hauts-de-France 1,01 1,05 0,86
Ile-de-France 1,03 1,07 0,94
Normandie 1,19 1,22 1,13
Nouvelle-Aquitaine 1,07 1,12 0,96
Occitanie 1,17 1,10 1,03
Pays de la Loire 1,19 1,05 1,04
Provence-Alpes-Côte d’Azur 1,10 1,15 0,97
Guadeloupe 1,01 1,25 0,78
Guyane 1,45 1,64 0,81
La Réunion 0,98 0,97 0,96
Martinique 1,17 1,71
Mayotte 0,76 0,33

Le “R” ou taux de reproduction expliqué en VIDEO

Coronavirus : comment faire descendre le R0 ?

La remontée du R0 correspond à un relâchement des gestes-barrières dans la population. Il est très important de porter impérativement un masque de protection lors des déplacements et respecter tous les gestes barrière (lavage des mains, distance, aération…) pour limiter la propagation du virus responsable du Covid-19.

Autre stratégie efficace : tester et isoler chaque malade atteint par le Covid-19 : “si on identifie suffisamment tôt les personnes contaminées à l’aide de tests, on peut (en quelque sorte) sortir ces personnes du circuit et les empêcher de contaminer leur entourage, évitant ainsi une propagation du R0” – il s’agit là de la stratégie recommandée par l’Organisation Mondiale de la Santé (OMS).

Mais pour le spécialiste, il est probable que seule la vaccination permettra véritablement d’éteindre l’épidémie de coronavirus : “c’est grâce à la vaccination que le R0 de la grippe saisonnière est tombé à 0,5 : il est donc très vraisemblable qu’en attendant la vaccination de l’ensemble de la population contre le Covid-19, on constate des oscillations permanentes au niveau de cet indicateur-clé“.

Merci au Dr. William Berrebi, gastro-entérologue et hépatologue, ancien interne des Hôpitaux de Paris, auteur du podcast Merci Docteur ! et de Virus-animaux-humains : des liaisons (très) dangereuses – Du SIDA au Covid-19.

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